В музее функционируют четыре основные выставки: «Древняя зоология», «Флора», «Фауна» и «Синантропы (происхождение человечества)». В нем выделены несколько тематических павильонов, как «Чудесный организм человека», «Водная биология», «Динозавры» и т. п.